Trung tâm Giám định Y khoa tỉnh Hoà Bình tiền thân là một bộ phận của Hội đồng Giám định Y khoa tỉnh Hà Sơn Bình với tên gọi là Phân Hội đồng khu vực Hoà Bình. Năm 1991, sau khi tách tỉnh được đổi thành Phòng Giám định y khoa thuộc Sở Y tế. Ngày 10/04/2006, Trung tâm Giám định Y khoa tỉnh Hoà Bình chính thức được thành lập theo Quyết định số 768/QĐ-UBND của Uỷ Ban Nhân dân tỉnh Hoà Bình.